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本題考查的是概念的關系。題目中，菱形是四邊形的一種，二者是真包含關系，四邊形真包含菱形。B項中，白蘿卜是蘿卜的一種，蘿卜真包含白蘿卜，二者的邏輯關系也是真包含關系，與題目中概念關系相同。綜上所述，B項正確。

A項，西紅柿也叫番茄，二者是同一個事物，因此二者的邏輯關系為全同關系。與題干中的概念的關系不一致，排除。

C項，花菜和黃花菜是兩種不同的蔬菜，因此二者的邏輯關系為全異關系。與題干中的概念的關系不一致，排除。

D項，金針菇是蘑菇的一種，金針菇真包含于蘑菇，因此二者的邏輯關系為真包含于關系。與題干中的概念的關系不一致，排除。

因此，本題正確答案為B。